2. Biologie Moléculaire -...
Embed Size (px)
Transcript of 2. Biologie Moléculaire -...
-
http: / /www.chusa.upmc.fr /d isc/b io_cel l
PACES
CAHIER D'EXERCICES de B IOCHIMIE
2012-2013
EDITE PAR LE DEPARTEMENT DE BIOLOGIE
2. Biologie Molculaire
L'tude des acides nucliques
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 2
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
CAHIER D'EXERCICES POUR PACES
BIOCHIMIE
I I . B I O L O G I E M O L E C U L A I R E : l ' t u d e d e s a c i d e s n u c l i q u e s
S O M M A I R E Page
1. Transcription . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2. Traduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 3. Rplication . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 4. Problme de rvision . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 5. QCM . . . . . . . . . . 10 A N N E X E S . I Code gntique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 II Codes des acides amins . . . . . . . . . . . 15
Image de couverture : Photographie en microscopie lectronique d'une fourche de rplication dficiente chez un mutant de levure. Une anomalie lors de la rplication d'ADN serait l'un des mcanismes contribuant l'instabilit gnomique (Science-26 juil 2002 www.sciencemag.org)
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 3
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
1. TRANSCRIPTION
1.1 Droulement de la transcription dun gne. LADN gnomique prsent ci-dessous contient la totalit de la squence dun gne codant une protine. Les segments nuclotidiques souligns correspondent aux squences dADN de ce gne retrouves dans lARNm.
1 5............................... CCTAGAGAAC TGTTCCTGGG GTCTGGGACC TTTGCGAAGG 3............................... GGATCTCTTG ACAAGGACCC CAGACCCTGG AAACGCTTCC
41 CAAGGAAGGG GTAACAGGAT TTCGGGCAGT TGCCCCTGCA GGGCCAATCT AGGCAAGTCC CCTGCGCCAT GTTCCTTCCC CATTGTCCTA AAGCCCGTCA ACGGGGACGT CCCGGTTAGA TCCGTTCAGG GGACGCGGTA
111 GTCCCTTCGT CTCCTTCTTC CTATATACAG GCCTCCCTCC ACCTGTCTTC TCAGAGCAGG TATAGGCAAG CAGGGAAGCA GAGGAAGAAG GATATATGTC CGGAGGGAGG TGGACAGAAG AGTCTCTTCC ATATCCGTTC
181 CAGTGCTGCC GTGCTCACCT GGGCTATGGC TCTTCTTTCA GGTGGGTCTC CGACCCTGAC TTCAACGTGG GTCACGACGG CACGAGTGGA CCCGATACCG AGAAGAAAGT CCACCCAGAG GCTGGGACTG AAGTTGCACC
251 GGGTGTGGGT GGAGGCTGGC CAGAGGGCCC TGTCCACCCT GGGGGAGGAG AGCCCAGGCC CTGATTACCT CCCACACCCA CCTCCGACCG GTCTCCCGGG ACAGGTGGGA CCCCCTCCTC TCGGGTCCGG GACTAATGGA
321 AGTCCCTCTC CACAGCGTTT TCGGCCACCC AGGCACGGAA GGGCTTCTGG GACTACTTCA GCCAGACCAG TCAGGGAGAG GTGTCGCAAA AGCCGGTGGG TCCGTGCCTT CCCGAAGACC CTGATGAAGT CGGTCTGGTC
391 CGGGGACAAA GGCAGGGTTG AGCAGATCCA TCAGCAGAAG ATGGCTCGCG AGCCCGCGTG AGTGCCCAGG GCCCCTGTTT CCGTCCCAAC TAGTCTAGGT AGTCGTCTTC TACCGAGCGC TCGGGCGCAC TCACGGGTAA
461 GGAAGGGGTG TAGGCGAAGG GAGGAGACAG CTGGGCCATG CCATGATGAC CTGCCTCTGC TGCCTCAACC CCTTCCCCAC ATCCGCTTCC CTCCTCTGTC GACCCGGTAC GGTACTACTG GACGGAGACG ACGGAGTTGG
531 GAGGATCAGT GCGCGATGAC TTGGGGACAA AGGAGATGAT GGAGGCTAGC AGTCTGACGG CCTGGATATC CTCCTAGTCA CGCGCTACTG AACCCCTGTT TCCTCTACTA CCTCCGATCG TCAGACTGCC GGACCTATAG
601 TGTCCCCTTC TCCAGGACCC TGAAAGACAG GCTGCAGGCC CGTCTGGATG ACCTGTGGGA AGACATCACT ACAGGGGAAG AGGTCCTGGG ACTTTCTGTC CGACGTCCGG GCAGACCTAC TGGACACCCT TCTGTAGTGA
671 CACAGCCTTC ATGACCAGGG CCACAGCCAT CTGGGGGACC CCTGAGGATC TACCTGCCCA GGCCCATTCC GTGTCGGAAG TACTGGTCCC GGTGTCGGTA GACCCCCTGG GGACTCCTAG ATGGACGGGT CCGGGTAAGG
741 TCTGGGGAGC ATACTGTGTG CTCTCCCCAT CTCCAGCCCC TCCCTCTGGG TTCCCAAGTT GAAGCCTAGA AGACCCCTCG TATGACACAC GAGAGGGGTA GAGGTCGGGG AGGGAGACCC AAGGGTTCAA CTTCGGATCA
811 CTTCTGGAAT AAATGAAATA GATGTTTATG GCCTGGCGTG AGTATGTTTG ACTCTCATTT GGACCATGTC GAAGACCTTA TTTACTTTAT CTACAAATAC CGGACCGCAC TCATACAAAC TGAGAGTAAA CCTGGTACAG
881 TGAAAGCAGT GGCCTCACCA CTATCCCCAA AGCACACCCA TCACCCACTC CATTCCCTTG CTGCTCTTTC ACTTTCGTCA CCGGAGTGGT GATAGGGGTT TCGTGTGGGT AGTGGGTGAG GTAAGGGAAC GACGAGAAAG
951 GGTTAGAGCA CCACGCTCCC TGCTATGTGA CTGAGGTAGC ..............................3 CCAATCTCGT GGTGCGAGGG ACGATACACT GACTCCATCG ..............................5
a. Quelle est la dfinition dun gne ? b. Quels sont les composants molculaires ncessaires la transcription ?
c. Comment se fait linitiation de la transcription ? d. Quelle partie de cette squence peut participer la rgulation de lexpression dun
gne, notamment par un signal hormonal. ?
e. Parmi les motifs de cette squence marqus en gras ( ggccaatct / tatata / gt / ag / aataaa / tatgtttg ) :
- Quels sont ceux qui dfinissent lorientation de la transcription ?
En quoi dfinissent-ils le brin sens, le brin matrice ?
- Quels sont ceux qui dfinissent le dbut et la fin de la transcription ?
- Quels sont ceux qui interviennent lors de la maturation du transcrit primaire ?
- A quoi correspondent les segments souligns dans cette squence ?
Quels motifs interviennent dans le processus qui permet de les runir ?
- Quel processus permet de retarder la dgradation en 3 de lARN ?
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 4
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
1.2 La maturation des transcrits primaires dARN chez les Eucaryotes comporte un autre vnement non voqu dans lexercice prcdent :
a. En quoi consiste-t-il ? b. Quelle est la particularit de la liaison ainsi tablie ? c. Citez la ou les fonctions associes cette modification.
1.3 Un pissage alternatif partir du site donneur de lintron 2 dun transcrit primaire contenant 7 exons (schmatis ci-dessous) peut aboutir plusieurs ARN messagers.
exon 1
exon
2
GU A AG
exon
3
exon
4
exon
5
exon
6
exon
7
. Quelles sont les diffrents ARNm qui peuvent tre produits partir de ce transcrit ? . Quelle est leur mode de formation ? . De faon gnrale, que permet lpissage alternatif dun gne pluri-exoniques ?
Au cours de lexcision-pissage, une liaison phosphodiester se cre dans les introns librs.
. Prcisez les caractristiques de cette liaison : nuclotides et fonctions impliqus.
2. TRADUCTION
2.1 Expression du gne de lapolipoprotine E Squence du gne codant pour lApolipoprotine E humaine(allle Epsilon 4). (Genbank : HUMAPOE4) 1 GGAACTTGAT GCTCAGAGAG GACAAGTCAT TTGCCCAAGG TCACACAGCT GGCAACTGGC AGACGAGATT CACGCCCTGG 80 81 CAATTTGACT CCAGAATCCT AACCTTAACC CAGAAGCACG GCTTCAAGCC CTGGAAACCA CAATACCTGT GGCAGCCAGG 160 161 GGGAGGTGCT GGAATCTCAT TTCACATGTG GGGAGGGGGC TCCTGTGCTC AAGGTCACAA CCAAAGAGGA AGCTGTGATT 240 241 AAAACCCAGG TCCCATTTGC AAAGCCTCGA CTTTTAGCAG GTGCATCATA CTGTTCCCAC CCCTCCCATC CCACTTCTGT 320 321 CCAGCCGCCT AGCCCCACTT TCTTTTTTTT CTTTTTTTGA GACAGTCTCC CTCTTGCTGA GGCTGGAGTG CAGTGGCGAG 400 401 ATCTCGGCTC ACTGTAACCT CCGCCTCCCG GGTTCAAGCG ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC CAAGTAGCTA GGATTACAGG 480 481 CGCCCGCCAC CACGCCTGGC TAACTTTTGT ATTTTTAGTA GAGATGGGGT TTCACCATGT TGGCCAGGCT GGTCTCAAAC 560 561 TCCTGACCTT AAGTGATTCG CCCACTGTGG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCGTGA GCTACCGCCC CCAGCCCCTC 640 641 CCATCCCACT TCTGTCCAGC CCCCTAGCCC TACTTTCTTT CTGGGATCCA GGAGTCCAGA TCCCCAGCCC CCTCTCCAGA 720 721 TTACATTCAT CCAGGCACAG GAAAGGACAG GGTCAGGAAA GGAGGACTCT GGGCGGCAGC CTCCACATTC CCCTTCCACG 800 801 CTTGGCCCCC AGAATGGAGG AGGGTGTCTG TATTACTGGG CGAGGTGTCC TCCCTTCCTG GGGACTGTGG GGGGTGGTCA 880 881 AAAGACCTCT ATGCCCCACC TCCTTCCTCC CTCTGCCCTG CTGTGCCTGG GGCAGGGGGA GAACAGCCCA CCTCGTGACT 960 961 GGGCTGCCCA GCCCGCCCTA TCCCTGGGGG AGGGGGCGGG ACAGGGGGAG CCCTATAATT GGACAAGTCT GGGATCCTTG 1040 1041 AGTCCTACTC AGCCCCAGCG GAGGTGAAGG ACGTCCTTCC CCAGGAGCCG GTGAGAAGCG CAGTCGGGGG CACGGGGATG 1120 1121 AGCTCAGGGG CCTCTAGAAA GAGCTGGGAC CCTGGGAAGC CCTGGCCTCC AGGTAGTCTC AGGAGAGCTA CTCGGGGTCG 1200 1201 GGCTTGGGGA GAGGAGGAGC GGGGGTGAGG CAAGCAGCAG GGGACTGGAC CTGGGAAGGG CTGGGCAGCA GAGACGACCC 1280 1281 GACCCGCTAG AAGGTGGGGT GGGGAGAGCA GCTGGACTGG GATGTAAGCC ATAGCAGGAC TCCACGAGTT GTCACTATCA 1360 1361 TTATCGAGCA CCTACTGGGT GTCCCCAGTG TCCTCAGATC TCCATAACTG GGGAGCCAGG GGCAGCGACA CGGTAGCTAG 1440 1441 CCGTCGATTG GAGAACTTTA AAATGAGGAC TGAATTAGCT CATAAATGGA ACACGGCGCT TAACTGTGAG GTTGGAGCTT 1520 1521 AGAATGTGAA GGGAGAATGA GGAATGCGAG ACTGGGACTG AGATGGAACC GGCGGTGGGG AGGGGGTGGG GGGATGGAAT 1600 1601 TTGAACCCCG GGAGAGGAAG ATGGAATTTT CTATGGAGGC CGACCTGGGG ATGGGGAGAT AAGAGAAGAC CAGGAGGGAG 1680 1681 TTAAATAGGG AATGGGTTGG GGGCGGCTTG GTAAATGTGC TGGGATTAGG CTGTTGCAGA TAATGCAACA AGGCTTGGAA 1760 1761 GGCTAACCTG GGGTGAGGCC GGGTTGGGGG CGCTGGGGGT GGGAGGAGTC CTCACTGGCG GTTGATTGAC AGTTTCTCCT 1840 1841 TCCCCAGACT GGCCAATCAC AGGCAGGAAG ATGAAGGTTC TGTGGGCTGC GTTGCTGGTC ACATTCCTGG CAGGTATGGG 1920 1921 GGCGGGGCTT GCTCGGTTCC CCCCGCTCCT CCCCCTCTCA TCCTCACCTC AACCTCCTGG CCCCATTCAG ACAGACCCTG 2000 2001 GGCCCCCTCT TCTGAGGCTT CTGTGCTGCT TCCTGGCTCT GAACAGCGAT TTGACGCTCT CTGGGCCTCG GTTTCCCCCA 2080 2081 TCCTTGAGAT AGGAGTTAGA AGTTGTTTTG TTGTTGTTGT TTGTTGTTGT TGTTTTGTTT TTTTGAGATG AAGTCTCGCT 2160 2161 CTGTCGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGCGGG ATCTCGGCTC ACTGCAAGCT CCGCCTCCCA GGTCCACGCC ATTCTCCTGC 2240 2241 CTCAGCCTCC CAAGTAGCTG GGACTACAGG CACATGCCAC CACACCCGAC TAACTTTTTT GTATTTTCAG TAGAGACGGG 2320 2321 GTTTCACCAT GTTGGCCAGG CTGGTCTGGA ACTCCTGACC TCAGGTGATC TGCCCGTTTC GATCTCCCAA AGTGCTGGGA 2400 2401 TTACAGGCGT GAGCCACCGC ACCTGGCTGG GAGTTAGAGG TTTCTAATGC ATTGCAGGCA GATAGTGAAT ACCAGACACG 2480 2481 GGGCAGCTGT GATCTTTATT CTCCATCACC CCCACACAGC CCTGCCTGGG GCACACAAGG ACACTCAATA CATGCTTTTC 2560 2561 CGCTGGGCCG GTGGCTCACC CCTGTAATCC CAGCACTTTG GGAGGCCAAG GTGGGAGGAT CACTTGAGCC CAGGAGTTCA 2640 2641 ACACCAGCCT GGGCAACATA GTGAGACCCT GTCTCTACTA AAAATACAAA AATTAGCCAG GCATGGTGCC ACACACCTGT 2720 2721 GCTCTCAGCT ACTCAGGAGG CTGAGGCAGG AGGATCGCTT GAGCCCAGAA GGTCAAGGTT GCAGTGAACC ATGTTCAGGC 2800 2801 CGCTGCACTC CAGCCTGGGT GACAGAGCAA GACCCTGTTT ATAAATACAT AATGCTTTCC AAGTGATTAA ACCGACTCCC 2880 2881 CCCTCACCCT GCCCACCATG GCTCCAAAGA AGCATTTGTG GAGCACCTTC TGTGTGCCCC TAGGTAGCTA GATGCCTGGA 2960 2961 CGGGGTCAGA AGGACCCTGA CCCGACCTTG AACTTGTTCC ACACAGGATG CCAGGCCAAG GTGGAGCAAG CGGTGGAGAC 3040 3041 AGAGCCGGAG CCCGAGCTGC GCCAGCAGAC CGAGTGGCAG AGCGGCCAGC GCTGGGAACT GGCACTGGGT CGCTTTTGGG 3120 3121 ATTACCTGCG CTGGGTGCAG ACACTGTCTG AGCAGGTGCA GGAGGAGCTG CTCAGCTCCC AGGTCACCCA GGAACTGAGG 3200 3201 TGAGTGTCCC CATCCTGGCC CTTGACCCTC CTGGTGGGCG GCTATACCTC CCCAGGTCCA GGTTTCATTC TGCCCCTGTC 3280
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 5
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
3281 GCTAAGTCTT GGGGGGCCTG GGTCTCTGCT GGTTCTAGCT TCCTCTTCCC ATTTCTGACT CCTGGCTTTA GCTCTCTGGA 3360 3361 ATTCTCTCTC TCAGCTTTGT CTCTCTCTCT TCCCTTCTGA CTCAGTCTCT CACACTCGTC CTGGCTCTGT CTCTGTCCTT 3440 3441 CCCTAGCTCT TTTATATAGA GACAGAGAGA TGGGGTCTCA CTGTGTTGCC CAGGCTGGTC TTGAACTTCT GGGCTCAAGC 3520 3521 GATCCTCCCG CCTCGGCCTC CCAAAGTGCT GGGATTAGAG GCATGAGCAC CTTGCCCGGC CTCCTAGCTC CTTCTTCGTC 3600 3601 TCTGCCTCTG CCCTCTGCAT CTGCTCTCTG CATCTGTCTC TGTCTCCTTC TCTCGGCCTC TGCCCCGTTC CTTCTCTCCC 3680 3681 TCTTGGGTCT CTCTGGCTCA TCCCCATCTC GCCCGCCCCA TCCCAGCCCT TCTCCCCCGC CTCCCCACTG TGCGACACCC 3760 3761 TCCCGCCCTC TCGGCCGCAG GGCGCTGATG GACGAGACCA TGAAGGAGTT GAAGGCCTAC AAATCGGAAC TGGAGGAACA 3840 3841 ACTGACCCCG GTGGCGGAGG AGACGCGGGC ACGGCTGTCC AAGGAGCTGC AGGCGGCGCA GGCCCGGCTG GGCGCGGACA 3920 3921 TGGAGGACGT GCGCGGCCGC CTGGTGCAGT ACCGCGGCGA GGTGCAGGCC ATGCTCGGCC AGAGCACCGA GGAGCTGCGG 4000 4001 GTGCGCCTCG CCTCCCACCT GCGCAAGCTG CGTAAGCGGC TCCTCCGCGA TGCCGATGAC CTGCAGAAGC GCCTGGCAGT 4080 4081 GTACCAGGCC GGGGCCCGCG AGGGCGCCGA GCGCGGCCTC AGCGCCATCC GCGAGCGCCT GGGGCCCCTG GTGGAACAGG 4160 4161 GCCGCGTGCG GGCCGCCACT GTGGGCTCCC TGGCCGGCCA GCCGCTACAG GAGCGGGCCC AGGCCTGGGG CGAGCGGCTG 4240 4241 CGCGCGCGGA TGGAGGAGAT GGGCAGCCGG ACCCGCGACC GCCTGGACGA GGTGAAGGAG CAGGTGGCGG AGGTGCGCGC 4320 4321 CAAGCTGGAG GAGCAGGCCC AGCAGATACG CCTGCAGGCC GAGGCCTTCC AGGCCCGCCT CAAGAGCTGG TTCGAGCCCC 4400 4401 TGGTGGAAGA CATGCAGCGC CAGTGGGCCG GGCTGGTGGA GAAGGTGCAG GCTGCCGTGG GCACCAGCGC CGCCCCTGTG 4480 4481 CCCAGCGACA ATCACTGAAC GCCGAAGCCT GCAGCCATGC GACCCCACGC CACCCCGTGC CTCCTGCCTC CGCGCAGCCT 4560 4561 GCAGCGGGAG ACCCTGTCCC CGCCCCAGCC GTCCTCCTGG GGTGGACCCT AGTTTAATAA AGATTCACCA AGTTTCACGC 4640 4641 ATCTGCTGGC CTCCCCCTGT GATTTCCTCT AAGCCCCAGC CTCAGTTTCT CTTTCTGCCC ACATACTGCC ACACAATTCT 4720 4721 CAGCCCCCTC CTCTCCATCT GTGTCTGTGT GTATCTTTCT CTCTGCCCTT TTTTTTTTTT TAGACGGAGT CTGGCTCTGT 4800 4801 CACCCAGGCT AGAGTGCAGT GGCACGATCT TGGCTCACTG CAACCTCTGC CTCTTGGGTT CAAGCGATTC TGCTGCCTCA 4880 4881 GTAGCTGGGA TTACAGGCTC ACACCACCAC ACCCGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ACGAGCTTTC ACCATGTTGG 4960 4961 CCAGGCAGGT CTCAAACTCC TGACCAAGTG ATCCACCCGC CGGCCTCCCA AAGTGCTGAG ATTACAGGCC TGAGCCACCA 5040 5041 TGCCCGGCCT CTGCCCCTCT TTCTTTTTTA GGGGGCAGGG AAAGGTCTCA CCCTGTCACC CGCCATCACA GCTCACTGCA 5120 5121 GCCTCCACCT CCTGGACTCA AGTGATAAGT GATCCTCCCG CCTCAGCCTT TCCAGTAGCT GAGACTACAG GCGCATACCA 5200 5201 CTAGGATTAA TTTGGGGGGG GGTGGTGTGT GTGGAGATGG GGTCTGGCTT TGTTGGCCAG GCTGATGTGG AATTCCTGGG 5280 5281 CTCAAGCGAT ACTCCCACCT TGGCCTCCTG AGTAGCTGAG ACTACTGGCT AGCACCACCA CACCCAGCTT TTTATTATTA 5360 5361 TTTGTAGAGA CAAGGTCTCA ATATGTTGCC CAGGCTAGTC TCAAACCCCT GGCTCAAGAG ATCCTCCGCC ATCGGCCTCC 5440 5441 CAAAGTGCTG GGATTCCAGG CATGGGCTCC GAGCGGCCTG CCCAACTTAA TAATATTGTT CCTAGAGTTG CACTC 5515
La squence ci-jointe est celle du brin sens du gne de l'apolipoprotine E humaine, allle 4. Le dernier nuclotide de chaque ligne est numrot sur la droite (n de position).
2.1.1 Certaines parties de cette squence ont t soulignes d'un trait simple; examinez
avec soin le dbut et la fin des squences qui sont situes entre ces squences soulignes : quoi correspondent les squences soulignes ?
2.1.2 Quelles sont les fonctions (rles) des protines qui se fixent en premier sur ce
gne dans la rgion allant du nuclotide 975 au nuclotide 1046 ? 2.1.3 Quel est le rle du triplet de nuclotides en 1871-1873 ? 2.1.4 Quelle est la traduction de la squence 1847-1913 de ce gne ? 2.1.5 Le nuclotide en position 1913 est un G qui fait partie de la squence traduite :
quelle est sa position dans le cadre de lecture : N1, N2 ou N3 ? 2.1.6 Le nuclotide en position 3007 est un G qui fait partie de la squence traduite :
quelle est sa position dans le cadre de lecture : N1, N2 ou N3 ? 2.1.7 Quelle sera la longueur aprs transcription et maturation (comprenant l'addition
de 1000 AMP du ct 3'-OH) de l'ARN messager de l'apolipoprotine E ? 2.1.8 Quel est le rle du codon (soulign deux fois) TGA en 4496 ? 2.1.9 Quels sont les numros des nuclotides de la bote de polyadnylation ? 2.1.10 La scrtion de la protine hors des cellules ncessite l'hydrolyse d'un peptide
de 18 acides amins du ct N-terminal. Quel est le rle de ce peptide ? 2.1.11 De combien d'acides amins se compose l'apolipoprotine E mature ?
2.2 Soit le schma ci-contre reprsentant un ARNt (avec son anticodon).
a. Quel est le nom de l'acide amin transport par cet ARNt ?
b. Quel est le nom du nuclotide situ l'extrmit 3' de cet ARNt ? c. Par quel type de liaison l'acide amin sera-t-il li cet ARNt ?
35
U A C
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 6
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
2.3 TRADUCTION Au cours de llongation du dbut de la protine, un ribosome se trouve successivement dans les deux tats ci-dessous :
- A gauche avant la synthse de la liaison peptidique, le site P porte un ARNt li au peptide Met-Ala-Val. Le ribosome vient de recruter un ARNt charg. - A droite, aprs la synthse de la liaison peptidique, les 2 ARNt sont encore fixs aux sites P et A. Prcisez les lments prsents aux sites P et A ce stade du processus.
2.4 Combien de liaisons phosphates riches en nergie sont consommes dans la synthse
d'une protine de 75 rsidus dacide amin ?
Justifiez votre rponse.
2.5. On estime que lensemble des molcules dADN prsentes dans le noyau dune cellule humaine (avant la phase de rplication) reprsente 6 x 109 paires de nuclotides. Quelle longueur totale dADN cela reprsente-t-il ? Justifiez vos calculs en prsentant votre raisonnement.
3. REPLICATION
3.1 La rplication La figure ci-contre schmatise la mise en place du processus de rplication dun chromosome : en a est reprsent une portion dADN bicatnaire et en b ce mme ADN au tout dbut de la rplication.
1. A quoi correspondent les 2 flches indiques en a ?
2. A quoi correspondent les structures semi-circulaires reprsentes en b ?
3. Quelles protines enzymatiques interviennent pour gnrer ces structures semi-circulaires et comment agissent-elles ?
4. Quel est lavantage pour la cellule de gnrer plusieurs de ces structures semi-circulaires sur un mme chromosome ?
La progression de la rplication est schmatise en c et d :
5. Reprer en c les brins parentaux et les brins no synthtiss dADN. 6. Dans cette reprsentation, avez-vous un argument pour assigner une orientation 5->3
lun des brins parentaux ?
7. Proposer en e une reprsentation schmatique du stade suivant de la rplication. 8. Nommer la partie encadre de la figure c ?
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 7
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
Cette partie encadre est agrandie dans la figure ci-dessous.
9. Identifier dans la liste suivante les lments de lgende 1 8 :
- ADN polymrase - Amorce
- Brin direct (ou avanc) - Brin retard
- Fragment dOkazaki - Primase + ADN polymrase
- Protine SSB - Topoisomrase + hlicase
10. Sur ce schma, dans quelle direction progresse la rplication ? 11. Quels sont les substrats de la primase ? de lADN polymrase ? 12. Y a-t-il ncessit damorcer la synthse dADN sur le brin direct ? 13. Pourquoi faut-il plusieurs amorces pour la synthse du brin retard ?
14. Quelles sont les ractions catalyses par lADN polymrase ? 15. Le sens de lecture du brin parental par lADN polymrase est-il le mme sur les 2
brins de lADN rpliquer ?
16. Le brin direct est-il toujours le mme sur toute la longueur du chromosome ?
Sur la figure, on a reprsent 2 petits encadrs : ils dlimitent 2 zones du brin no synthtis qui ont t le sige de ractions trs prcises ne laissant aucune de trace sur lADN final : 17. De quelles ractions sagit-il ?
3.2 Quel problme se pose lors de la rplication de lextrmit des chromosomes ?
Quelle activit enzymatique spcifique permet dy rpondre ?
Quelle particularit structurale prsente cette enzyme ?
1 2
3 4
5
6
7 5 3
3
5
8
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 8
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
4. PROBLEME DE REVISION: SEQUENCE, TRANSCRIPTION ET TRADUCTION DU GENE SPO II G.
Cet exercice est organis autour de lexploitation dune squence nuclotidique. On se propose danalyser cette squence en vue dtudier successivement :
- le sens de transcription, - le cadre de lecture - lenchanement des acides amins - une proprit biologique de la protine,
La squence dADN reprsente ci-dessous est celle dun fragment de 120 paires de bases entirement contenu dans la partie traduite du gne spo II G de la bactrie Bacillus subtilis.
5P 1 11 21 31
G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T T G A C G C A C C T C T G G T A T A A G
41 51 61 71
C T G C T G A T G A A A C T T G G G C T G A A A A G T G A T G A A G T C T A T T
81 91 101 111
A C A T A G G C G G G A G T G A A G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A
3 OH
1 Le sens de transcription
a. Sachant que la squence donne est celle du brin sens, indiquer par une flche sur la squence ci-dessous le sens de progression de la transcription. Justifier.
G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T...............G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A
1 11 101 111
2 Le cadre de lecture
a. Thoriquement linformation gntique porte par lARNm peut tre traduite de trois faons diffrentes. Pourquoi ?
b. Donner dans le tableau I ci-dessous les diffrentes squences prises par les trois codons stop au niveau des trois brins dacide nuclique.
TABLEAU I
5 P 3 OH Squences des codons non-sens 1er type 2me type 3me type
ARNm brin dADN sens brin dADN transcrit
c. Avec des barres verticales, dfinir les trois cadres de lecture potentiels de la squence tudie. Dans chaque cas encadrer les codons stop.
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 9
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
1er CADRE DE LECTURE POTENTIEL 1 11 21 31
G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T T G A C G C A C C T C T G G T A T A A G 41 51 61 71
C T G C T G A T G A A A C T T G G G C T G A A A A G T G A T G A A G T C T A T T 81 91 101 111
A C A T A G G C G G G A G T G A A G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A
2me CADRE DE LECTURE POTENTIEL 1 11 21 31
G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T T G A C G C A C C T C T G G T A T A A G 41 51 61 71
C T G C T G A T G A A A C T T G G G C T G A A A A G T G A T G A A G T C T A T T 81 91 101 111
A C A T A G G C G G G A G T G A A G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A
3me CADRE DE LECTURE POTENTIEL 1 11 21 31
G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T T G A C G C A C C T C T G G T A T A A G 41 51 61 71
C T G C T G A T G A A A C T T G G G C T G A A A A G T G A T G A A G T C T A T T 81 91 101 111
A C A T A G G C G G G A G T G A A G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A
d. Quel est le cadre de lecture effectivement utilis pour la synthse de la protine ?
e. Si au cours dune exprience prliminaire on tablit la squence dun seul brin dun fragment dADN que lon sait tre interne un gne, il est possible, au moins en thorie de dterminer le sens de la transcription. Comment ?
3 Lenchanement des acides amins
Identifier sur la squence ci-dessous lextrmit qui code pour la rgion N-terminale du fragment protique. Justifier.
1 11 111
GAAAAAACTG AAAT ................................CCTC CATTATCTAA
4 Une proprit biologique de la protine
Le tableau II prsente la composition en acides amins du fragment protique analys.
TABLEAU II
Acide amin Ala Arg Asp Glu Gly His Ile Leu Lys Met Pro Ser Thr Trp Tyr Val
Nombre 1 1 1 2 3 1 1 10 6 1 3 3 1 1 3 1
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 10
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
La protine code par le gne spo II G interagit avec lADN. Ce fait est-il compatible avec la composition en acides amins du fragment analys ? Pourquoi ?
5 SOIT UNE SEQUENCE CODANTE DE 18 NUCLEOTIDES
ADN
DOUBLE
. . . CAT ATA . . .
-BRIN . . .
GAA . . .
ARNm . . .
GUC . . .
ANTICODON
des ARNt
CAG
ACIDE
AMINE
lys trp
a. Dterminer le sens de transcription. Justifier.
b. Orienter lARNm, les deux brins de la molcule dADN et complter le tableau.
c. Orienter la chane polypeptidique en prcisant les extrmits NH2 et COOH-terminales.
5. QCM (incluant des questions dannales du concours)
Tous les QCMs seront mis en ligne sous forme de tests sur MonUPMC (module SAKAI). Un corrig comment de chaque question sera disponible aprs avoir rpondu aux questions.
1. Structure des acides nucliques 1. Ci-dessous un fragment dacide nuclique :
a. Cette squence scrit ATGC b. Sa squence complmentaire scrit TACG c. Elle est compose de ribonuclotides d. Elle contient des liaisons anhydrides e. Sous forme double brin, sa temprature de
fusion est suprieure celle dune squence AAAA
2. Le nuclotide compos reprsent ci-dessous
!
O!-! P!O!O!-!
O! P! O!O!-!O!
P!O!O!-!
O! C!H!2!O!
O!H! O!H!
N!N!
N!N!
N!H!2!
a. est ladnosine triphosphate b. contient du dsoxyribose c. possde 2 liaisons riches en nergie d. possde 2 liaisons phosphoester e. sert de prcurseur la synthse dARN
3. Parmi les caractres suivants indiquer le(s)quel(s) sapplique(nt) un nuclotide compris dans la structure dun acide ribonuclique: a. Il contient toujours des atomes de carbone,
dhydrogne, doxygne, de phosphore et dazote b. Il contient trois fonctions acides dont deux
estrifies c. Il contient une liaison N-osidique d. Il contient une base azote, purine ou
pyrimidine e. Il contient un ose six carbones (hexose)
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 11
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
4. La figure suivante reprsente un fragment dacide nuclique de quatre nuclotides (nt).
Parmi les squences suivantes lesquelles reprsentent une molcule qui s'hybrident parfaitement avec le fragment de 4 nt ci-dessus reprsent : a. AGTCTCAGC b. TCAGACTAG c. AGTCAGACT d. GACTGAGTC e. ACTCAGACT
5. Dans l'ADN, quelles sont les propositions
justes a. Les bases G et C sont apparies par deux
liaisons hydrognes. b. Les bases pyrimidiques sont apparies
entre elles. c. Le dsoxyribose correspond une
molcule de ribose dans laquelle le OH en position 3' est remplac par un H.
d. Dans une molcule d'ADN, le caractre polyanionique est d lionisation du rsidu phosphate.
e. Les deux chanes d'une molcule d'ADN sont anti-parallles.
6. Dans l'ADN, indiquez le ou les couple(s) de
trinuclotide(s) complmentaire(s) en tenant compte des conventions d'criture des squences (c'est--dire de 5' vers 3')
a. AAC et GTT b. AAC et TTG c. CAT et GTA d. CAT et ATG e. CTA et GAT
7. Parmi les structures suivantes, quelles sont
celles qui existent dans un ADN normal :
a. d. b. e. c
8. Dans la structure du fragment d'ADN reprsent par la squence A C T C , quelles sont les liaisons, fonctions, molcules simples ou groupes d'atomes prsentes :
a. Quatre liaisons N-osidiques b. Quatre -D-riboses c. Un noyau purine d. Trois fonctions amine primaire libres e. Deux cytidines
2. Transcription 1. Au cours de la transcription, quelles sont les
espces chimiques qui ont un rle jouer : a. Une RNA polymrase b. ribonuclotides c. dsoxy- thymidine triphosphate (dTTP) d. protine liant la bote TATA (TBP) e. guanosine triphosphate
2. Les ARN messagers (ARNm) a. sont toujours synthtiss dans le sens 5 3 b. sont toujours traduits dans le sens 5 3 c. comportent toujours tous les exons du gne d. ont toujours une coiffe 7-mthylguanosine
triphosphate en 5 e. ont toujours au moins un codon AUG
3. Indiquer parmi les propositions suivantes
celle(s) qui est (sont) exacte(s). La queue polyA :
a. Existe dans tous les ARN b. Est synthtise par l'ARN polymrase II c. Est synthtise sans matrice d. Est synthtise sans amorce e. S'hybride un oligodT
4. Indiquer parmi les propositions suivantes
celle(s) qui est (sont) exacte(s). La bote TATA : a. Est un facteur trans-rgulateur b. Interagit avec TFIID par lintermdiaire des 2
brins de lADN c. Son accessibilit au complexe dinitiation de la
transcription est conditionne par ltat de la chromatine
d. Est localise en 5 par rapport la bote CAAT sur le brin sens
e. Est localise en 5 par rapport au site dinitiation de la transcription sur le brin anti-sens
5. La transcription d'un gne codant une protine a. a lieu sur les ribosomes. b. met en jeu l'ARN polymrase II. c. utilise des dsoxyribonuclotides
triphosphates. d. a lieu sur les deux brins. e. fait intervenir la fixation de facteurs
transcriptionnels sur le promoteur.
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 12
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
6. Quelles sont parmi les proprits suivantes
celles qui sont en accord avec la dfinition des exons et des introns chez les Eucaryotes :
a. lexon est une squence de nuclotides b. lintron est dlimit en 5 par un site donneur
5TG et en 3 par un site receveur AG. c. la queue poly A ne fait partie daucun exon d. les introns sont transforms en lassos, puis
dtruits par la ribonuclase e. un exon est toujours situ entre deux introns 7. Indiquer parmi les propositions suivantes
celle(s) qui est (sont) exacte(s). TFIIH : a. Est une hlicase b. Peut sparer les 2 brins de l'ADN c. Fait partie du complexe d'initiation de la transcription d. Peut intervenir dans la traduction de lARNm en protine e. Se lie la bote TATA
8. Parmi les propositions suivantes sur la
transcription certaines sont exactes, lesquelles?
a. La transcription ne concerne que la production des ARN messagers
b. La transcription des ARN de transfert est ralise par l'ARN polymrase III
c. La transcription utilise toujours les 2 brins du gne comme matrice, ce qui permet la production de 2 molcules d'ARN messager diffrentes
d. La transcription ncessite l'ouverture de l'hlice d'ADN
e. Seuls les exons sont transcrits
9. Indiquer parmi les propositions suivantes celle(s) qui est (sont) exacte(s).
Le facteur TFIID : a. Est un facteur de transcription b. Se fixe sur le promoteur des gnes c. Est une protine de liaison de l'ADN d. Interagit avec la bote CAAT e. Est associ l'ARN polymrase II jusqu' la
fin de la transcription 10. Parmi les propositions suivantes concernant
la squence de tous les ARN messagers, lesquelles sont exactes a. elle dbute par un codon AUG b. elle se termine par un signal de
polyadnylation c. elle est forme exclusivement d'une
squence codant une protine d. elle possde son extrmit 5' une coiffe
forme d'un nuclotide mthylguanosine e. elle contient toujours un codon stop
11. LARN messager chez les eucaryotes a. possde une squence complmentaire du
brin codant de lADN gnomique b. ne comporte pas les introns c. peut comporter une partie seulement des
exons d. est toujours entirement traduit e. possde une longue rptition
polyadnylique
12. Le promoteur : a. Fait partie du gne b. Dtermine le sens de la transcription c. Sa squence est numrote en se rfrant au
brin sens du gne d. Il est situ en 3 de la squence codante e. Le facteur TFIID se fixe sur les 2 brins de
lADN constituant la boite TATA
3. Traduction 1. Indiquer parmi les propositions suivantes
celle(s) qui est (sont) exacte(s). Au cours de la traduction : a. L'tape d'initiation fait intervenir le facteur
TFIID b. L'ARNt-Met est indispensable l'initiation c. La liaison de l'ARNt-Met dtermine le cadre de
lecture d. La synthse d'un ARNt-Met ncessite
l'hydrolyse d'une liaison riche en nergie e. Le recrutement d'un ARNt-Met au site P du
ribosome ncessite l'hydrolyse d'une liaison riche en nergie
2. Quel est (ou quels sont) le(s) triplet(s)
nuclotidique(s) du (ou des) anti-codon(s) du (ou des) ARNt Glu s'appariant avec les codons de l'acide glutamique GAA et GAG?
a. CUU b. CUC c. UUC d. TTC e. CTC
3. Quelle(s) est (sont) la (ou les) affirmation(s)
vraie(s) concernant la traduction : a. LARN messager mature est toujours traduit
dans sa totalit b. AUG est un codon de terminaison de la
traduction c. Le code gntique est fond sur des mots de
3 lettres les codons d. Le codon de lARNm AUG est
complmentaire de lanticodon CAU de lARNt e. Le bilan nergtique de la traduction est
fonction du nombre dacides 4. Le bilan nergtique total de lincorporation de
chaque acide amin lors de la traduction : a. Est de 3 liaisons riches en nergie b. Prend en compte lnergie ncessaire la
synthse de laminoacyl-ARNt c. Est suprieur au bilan nergtique de
lincorporation de chaque nuclotide lors de la transcription
d. Prend en compte lhydrolyse de molcules dATP
e. Prend en compte lhydrolyse de molcules
5. Les ARN de transfert (ARNt) a. reprsentent le type dARN le plus abondant
de la cellule b. sont au nombre de 20 c. chacun dentre eux se lie un seul acide
amin d. chacun dentre eux se lie un seul codon e. se lient aux acides amins par lintermdiaire
dune liaison riche en nergie
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 13
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
6. Indiquer parmi les propositions suivantes
celle(s) qui est (sont) exacte(s). La molcule Trp-tRNA : a. Comporte une liaison riche en nergie b. Comporte l'anticodon 5' ACC 3' c. Se lie au facteur eIF2-GTP d. Est synthtis par la srine tRNA
synthtase e. Passe du site P au site A lors de la
translocation du ribosome
7. La squence nuclotidique de l'anticodon d'un ARNt est 5' -CCU - 3' quelle est dans la squence suivante d'un ARN messager le triplet nuclotidique qui pourra s'apparier l'anticodon ?
a. b. c. d. e.
8. La lysyl-tRNA synthtase reconnat spcifi-
quement quel(s) ligand(s) parmi les suivants : a. ARNt dont la boucle centrale porte
lanticodon UUU b. AMP c. ion Mg++ d. Lysine e. ARNt dont la boucle centrale porte
lanticodon AAA 9. Synthse protique : a. La synthse protique dbute par l'acide
amin N terminal et se termine par l'acide amin C terminal
b. Les acides amins sont activs par une liaison ester aux molcules d'ARN t
c. La terminaison d'une synthse protique requiert la liaison d'un t RNA terminateurs un codon stop du mRNA
d. On trouve de la thymine dans la majorit des tRNA
e. La mobilisation du peptidyl-tRNA du site A au site P sur le ribosome est rendue possible par l'hydrolyse de L'ATP
10. Quelle(s) liaisons est (sont) hydrolyse(s) ou
rompue(s) au cours de llongation dune protine, chaque acide amin incorpor :
a. Liaison ester lextrmit 3-OH de lARNt du site peptidique
b. Liaison anhydride dacides entre les phosphates du GTP li au ribosome et au facteur eEF2 lors de la translocation du messager
c. Liaisons hydrogne entre lanticodon de lARNt devenu libre du site peptidique et le codon de lacide amin incorpor ltape prcdente
d. Liaison anhydride dacides entre les phosphates du GTP fix sur le facteur eEF1
e. Liaison amide entre lextrmit COOH-terminale du peptide en cours de synthse et la fonction amine de lacide amin incorpor
4. Rplication 1. La synthse du brin retard par l'ADN
polymrase se distingue de celle du brin rapide parce que:
a. elle consomme moins de dsoxyribo-nuclosides triphosphates
b. elle fait intervenir beaucoup plus souvent les enzymes ADN-primase et ADN-ligase
c. elle engendre la production des fragments d'Okazaki
d. elle fait appel des amorces plus nombreuses e elle se fait contre-sens du dplacement de
l'enzyme sur l'ADN 2. Au cours de la rplication de lADN,
lincorporation dun dsoxyribonuclotide a. est catalyse par une ADN polymrase b. consomme lnergie fournie par lhydrolyse de
deux liaisons riches en nergie c. peut avoir lieu lextrmit 3-OH ou 5-OH
dun brin amorce dADN d. peut avoir lieu lextrmit 3-OH ou 5-OH
dun brin amorce dARN synthtis par une primase
e. peut avoir lieu lextrmit 3-OH dun brin amorce dARN synthtis par une tlomrase
3. Quelle(s) est (sont) la (ou les) affirmation(s)
vraie(s) concernant la rplication : a Les 2 brins de lADN parental servent chacun
de modle pour la synthse dun nouveau brin au cours de la rplication
b. Lhlicase sert stabiliser les brins spars c. Les ADN Polymrases ont une activit
exonuclasique d. Le Mg++ est facultatif pour lactivit des ADN
polymrases e. LADN Polymrase est associe la primase
et lADN Polymrase est la principale enzyme de rplication en synthtisant sur le brin direct aussi bien que sur le brin retard
4. Indiquer parmi les propositions suivantes
celle(s) qui est (sont) exacte(s). Les tlomres : a. Recouvrent une centaine de paires de bases b. Sont constitus de squences dADN rptes
inverses c. Forment une extrmit 5 saillante d. Permettent dviter la fusion des chromosomes e. Adoptent une structure en boucle
5. Quelle est l'activit enzymatique, retrouve
chez la plupart des ADN polymrases, qui leur permet d'assurer une trs grande fidlit de la rplication?
a. Activit d'exonuclase 3' ----> 5' b. Activit d'exonuclase 5' ----> 3' c. Activit de polymrase d. Activit d'endonuclase e. Activit de synthse d'amorce
6. Indiquer parmi les propositions suivantes
celle(s) qui est (sont) exacte(s). La primase: a. Est une ARN polymrase b. Ncessite une amorce c. Ncessite une matrice d. Intervient dans la synthse des tlomres e. A une activit exonuclasique
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 14
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
7. On rencontre des acides nucliques hybrides (brins de ribonuclotides et de dsoxyribo-nuclotides lis de faon antiparallle et complmentaire) dans la (les) circonstance(s) suivante(s) :
a. entre l'amorce et le brin avanc de ADN au cours de la rplication
b. au cours des ractions catalyses par la tlomrase
c. entre un lment cis-rgulateur et un facteur trans-rgulateur
d. entre l'amorce et le brin retard de ADN au cours de la rplication
e. dans le site catalytique d'une RNA polymrase
8. Indiquer parmi les propositions suivantes la ou
les enzyme(s) ncessaire(s) la synthse des tlomres :
a. Tlomrase b. ADN polymrase c. Endonuclase d. Primase e. ADN ligase
9. La tlomrase a. synthtise une squence rpte dADN b. utilise une matrice dADN c. utilise comme amorce lextrmit 3-OH dun
brin dADN d. utilise une matrice dARN e. utilise comme amorce lextrmit 3-OH dun
brin dARN 10. Les principes et mcanismes gnraux de la
rplication a. Il est ncessaire d'ouvrir la molcule
d'ADN en un point prcis pour procder enzymatiquement sa rplication in vivo.
b La synthse d'un brin nouveau d'ADN ncessite toujours la fabrication pralable d'une amorce d'ARN.
c. Il existe au niveau d'une fourche de rplication, deux molcules d'ADN polymrases fonctionnement simultan mais diffrent, l'une allongeant un brin d'ADN dans le sens 5' --->3' et l'autre allongeant l'autre brin dans le sens 3'--->5'.
d. Le brin dit "prcoce" est celui synthse discontinue et le brin dit "tardif" est celui synthse continue.
e. Dans une boucle de rplication, les deux fourches progressent en direction oppose, la mme vitesse.
11. LADN polymrase : a. Synthtise lADN dans le sens 3 -> 5 b. Possde une activit exonuclasique 3 -> 5 c. Dbute lincorporation de nuclotides
lextrmit 3 OH dun dsoxyribonuclotide d. Utilise une matrice dADN e. Synthtise les fragments dOkasaki
12. Indiquer parmi les propositions suivantes celle(s) qui est (sont) exacte(s). Le pyrophosphate :
a. peut tre libr au cours de la synthse d'ADN b. peut tre libr au cours de la synthse
d'aminoacyl-ARNt c. peut tre libr partir d'un nucloside
monophosphate d. comporte 2 liaisons riches en nergie e. comporte une liaison anhydride
13. La rplication de l'ADN des eucaryotes a. utilise des dsoxyribonuclotides
triphosphates. b. fait intervenir de l'ARN. c. dbute en un seul site. d. met en jeu des ADN polymrases
bidirectionnelles. e. est semi-conservative.
14. Au cours de la rplication a. la croissance de la chane se fait toujours
dans le sens 5' ----->3' b. les deux brins de l'ADN se sparent grce
des protines. c. les prcurseurs sont les
dsoxyribonuclotides pour un brin et les ribonuclotides pour l'autre.
d. il y a un pissage de l' ADN noform. e.la synthse est continue pour un brin d'ADN et
discontinue pour l'autre. 15. LATP est utilis comme source directe
dnergie au cours de la (des) raction(s) enzymatique(s) suivante(s):
a. Incorporation dun dsoxy-guanylate lextrmit 3 dune chane dacide nuclique
b. Incorporation dun adnylate lextrmit 3 dune chaine dacide nuclique
c. Synthse dun aminoacyl-ARNt d. Recrutement dun aminoacyl-ARNt sur la petite
sous-unit ribosomique e. Formation dune liaison phospho-ester par
lADN ligase
-
Cahier d'Exercices de Biochimie / PACES Biologie Molculaire / 15
Facult de Mdecine Pierre & Marie Curie
ANNEXE I.
CODE GENETIQUE
1er
Nuclotide 2me
Nuclotide U C A G
3me Nuclotide
U
Phe Ser Tyr Cys Phe Ser Tyr Cys Leu Ser Stop Stop Leu Ser Stop Trp
U C A G
C
Leu Pro His Arg Leu Pro His Arg Leu Pro Gln Arg Leu Pro Gln Arg
U C A G
A
Ileu Thr Asn Ser Ileu Thr Asn Ser Ileu Thr Lys Arg Met Thr Lys Arg
U C A G
G
Val Ala Asp Gly Val Ala Asp Gly Val Ala Glu Gly Val Ala Glu Gly
U C A G
ANNEXE II. - Codes des acides amins
A : ala F : phe K : lys P : pro T : thr
C : cys G : gly L : leu Q : gln V : val
D : asp H : his M : met R : arg W : trp
E : glu I : ile N : asn S : ser Y : tyr