MÉMO ORGANISATEUR (prof

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Auteurs BATON Stéphane – GIRARD Laura – GUILLOUX Amandine

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BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

MÉMO ORGANISATEUR (prof)

Éléments du jeu Cachette ou lieu

d’affichage

Eléments « Ne pas toucher »

Affiche QR CODE

Pochette avec dossier chercheur

FOUILLE BIOMOLECULES

3 rectangles de couleurs

Association [molécule – chiffre ou « ? »]

3 rectangles de couleurs

FOUILLE NEPHRON

QR code + éléments du néphron

ENIGME VOLUMETRIE

Mode opératoire

Formule de calcul pour le dosage volumétrique

ENIGME IDENTIFICATION

BACTERIENNE

Orientation de l’identification

Lecture de la galerie API STAPH

Lecture de la galerie API 20E

Fiche de résultats galerie API 20E et API STAPH

ENIGME DENOMBREMENT

Mode opératoire

Tableau de codes pour le dénombrement

Exploitation des résultats du dénombrement

ENIGME SPECTRO-

PHOTOMETRIE

Mode opératoire

Alphabet à décrypter

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BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

POST-IT (à afficher sur les endroits sensibles (placards, …))

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3

BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

Modèle lecture QR code (à afficher sur le mur)

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4

BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

Modèle lecture QR code (à afficher sur le mur)

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5

BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

AFFICHES FOUILLE BIOMOLÉCULES – (à afficher sur le mur)

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6

BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

FOUILLE BIOMOLÉCULES – (à cacher)

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7

BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

FOUILLE BIOMOLÉCULES – (à cacher)

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8

BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

FOUILLE BIOMOLÉCULES – (à cacher)

GLUCIDE

LIPIDE

PROTIDE

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BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

Glomérule Tube

Contourné Proximal

Tube Contourné

Distal

Tube Collecteur

Anse de Henlé

FOUILLE REIN/NÉPHRON – (à cacher)

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10

BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

FOUILLE REIN/NÉPHRON – (à cacher)

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Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

ÉNIGME – Dosage volumétrique

DOCUMENTS ÉLÈVES (à placer sur la paillasse)

C (OH-; NaOH) = 0,10 mol.L-1

Veq solution NaOH : à déterminer

V acide chlorhydrique = 10 mL

C(acide chlorhydrique ; solution X) => inconnue à déterminer

Quelques gouttes de Bleu de thymol

Indicateur coloré de pH

Les deux premiers chiffres du Véq donne le début du code

Le premier chiffre de la concentration donne la fin du code

≈ 20 mL d’eau déminéralisée

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BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

DOCUMENTS ÉLÈVES (à cacher)

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BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

ÉNIGME IDENTIFICATION BACTERIENNE (à glisser dans le dossier du chercheur)

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MICROGALERIE API STAPH - (à placer sur la paillasse)

BIOTECH’SCAPE

Lecture de la microgalerie API STAPH

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BIOTECH’SCAPE Portfolio

Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

MICROGALERIE API 20E - (à placer sur la paillasse)

BIOTECH’SCAPE

Lecture de la microgalerie API 20 E

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Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

FICHE RESULTATS - (à glisser dans le dossier du chercheur)

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Documents élèves à disperser et placer dans le laboratoire

ÉNIGME – Dénombrement Objectif : déterminer le code à 3 chiffres en calculant la concentration en nombre de … par mL d’échantillon Matériels à disposition : 3 boites correspondant aux dilutions 10-4, 10-5, et 10-6 obtenus en J2 (après incubation de 48h à 37°C). Mode opératoire déjà réalisé (à ne pas refaire) :

Technique utilisée : dénombrement en surface

Milieu utilisé : PCA

Matériel biologique : échantillon liquide

→ Réaliser des dilutions en série de l’échantillon de 10-1 à 10-6.

→ Vortexer chaque dilution avant de prélever.

Schéma du mode opératoire du dénombrement de la souche X

DOCUMENTS ÉLÈVES (à placer sur la paillasse)

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ÉNIGME DENOMBREMENT - (à cacher)

CN (… ; échantillon biologique) Code

[1,0.101 - 3,9.101] 102

[4,0.101 - 6,9.101] 111

[7,0.101 - 9,9.101] 124

[1,0.102 - 3,9.102] 136

[4,0.102 - 6,9.102] 131

[7,0.102 - 9,9.102] 140

[1,0.103 - 3,9.103] 157

[4,0.103 - 6,9.103] 169

[7,0.103 - 9,9.103] 171

[1,0.104 - 3,9.104] 183

[4,0.104 - 6,9.104] 199

[7,0.104 - 9,9.104] 204

[1,0.105 - 3,9.105] 213

[4,0.105 - 6,9.105] 225

[7,0.105 - 9,9.105] 237

[1,0.106 - 3,9.106] 245

[4,0.106 - 6,9.106] 259

[7,0.106 - 9,9.106] 261

[1,0.107 - 3,9.107] 270

[4,0.107 - 6,9.107] 286

[7,0.107 - 9,9.107] 296

[1,0.108 - 3,9.108] 302

[4,0.108 - 6,9.108] 312

[7,0.108 - 9,9.108] 320

[1,0.109 - 3,9.109] 333

[4,0.109 - 6,9.109] 342

[7,0.109 - 9,9.109] 357

[1,0.1010 - 3,9.110] 361

[4,0.1010 - 6,9.1010] 375

[7,0.1010 - 9,9.1010] 389

[1,0.1011 - 3,9.1011] 394

[4,0.1011 - 6,9.1011] 403

[7,0.1011 - 9,9.1011] 425

[1,0.1012 - 3,9.1012] 437

[4,0.1012 - 6,9.1012] 445

[7,0.1012 - 9,9.1012] 451

[1,0.1013 - 3,9.1013] 462

[4,0.1013 - 6,9.1013] 478

[7,0.1013 - 9,9.1013] 486

[1,0.1014 - 3,9.1014] 499

[4,0.1014 - 6,9.1014] 503

CN (… ; échantillon biologique) Code

[7,0.1014 - 6,9.1014] 515

[1,0.1015 - 3,9.1015] 523

[4,0.1015 - 6,9.1015] 546

[7,0.1015 - 9,9.1015] 555

[1,0.1016 - 3,9.1016] 567

[4,0.1016 - 6,9.1016] 574

[7,0.1016 - 9,9.1016] 586

[1,0.1017 - 3,9.1017] 590

[4,0.1017 - 6,9.1017] 611

[7,0.1017 - 9,9.1017] 624

[1,0.1018 - 3,9.1018] 631

[4,0.1018 - 6,9.1018] 648

[7,0.1018 - 9,9.1018] 654

[1,0.1019 - 3,9.1019] 667

[4,0.1019 - 6,9.1019] 676

[7,0.1019 - 9,9.1019] 689

[1,0.1020 - 3,9.1020] 692

[4,0.1020 - 6,9.1020] 705

[7,0.1020 - 9,9.1020] 711

[1,0.1021 - 3,9.1021] 736

[4,0.1021 - 6,9.1021] 743

[7,0.1021 - 9,9.1021] 763

[1,0.1022 - 3,9.1022] 771

[4,0.1022 - 6,9.1022] 789

[7,0.1022 - 9,9.1022] 808

[1,0.1023 - 3,9.1023] 831

[4,0.1023 - 6,9.1023] 845

[7,0.1023 - 9,9.1023] 860

[1,0.1024 - 3,9.1024] 876

[4,0.1024 - 6,9.1024] 888

[7,0.1024 - 9,9.1024] 892

[1,0.1025 - 3,9.1025] 900

[4,0.1025 - 6,9.1025] 913

[7,0.1025 - 9,9.1025] 928

[1,0.1026 - 3,9.1026] 939

[4,0.1026 - 6,9.1026] 945

[7,0.1026 - 9,9.1026] 956

[1,0.1027 - 3,9.1027] 962

[4,0.1027 - 6,9.1027] 985

[7,0.1027 - 9,9.1027] 990

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ÉNIGME DENOMBREMENT - (à cacher)

Exploitation des résultats Le calcul de la concentration en nombre de bactérie par mL d’échantillon se fait en utilisant la formule suivante :

CN (… ; échantillon biologique) = 𝜮𝒄

𝑽 . 𝟏,𝟏 . 𝒅

CN (… ; échantillon biologique) : concentration en nombre de bactérie par mL d’échantillon

Σc : somme des colonies comptées sur les deux boites retenues de deux dilutions successives et dont au moins une

contient au minimum dix colonies et maximum 300 colonies.

V : volume de l’inoculum déposé dans chaque boite (en mL)

d : dilution correspondant a la premiere boite retenue (dilution la plus faible).

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ÉNIGME – Spectrophotométrie

I. Spectre d’absorption

Réaliser le spectre d’absorption de la solution notée « X » sur un volume total de 1 mL contre un blanc composé d’eau déminéralisée.

Les mesures de longueurs d’ondes () seront faites tous les 50 nm dans un intervalle de 400 à 800 nm. On admettra que la longueur d’onde optimale sera celle correspondant à l’absorbance la plus élevée.

DEBUT DU CODE

DOCUMENTS ÉLÈVES (à placer sur la paillasse)

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II. Gamme d’étalonnage

• Réaliser une gamme d’étalonnage de la solution X a 100 g.L-1 a l’aide du tableau suivant : ➔ Limite de linéarité = 70 g.L-1

Cuve 1 2 3 4 5 6

V (solution X étalon diluée) (mL) 0 0,2 0,4 0,6 0,8 1

Veau déminéralisée (mL) 1 0,8 0,6 0,4 0,2 0

(molécule absorbante ; solution X étalon diluée) (g.L-1) 0 10 20 30 40 50

• Mesurer les absorbances a la longueur d’onde optimale contre le blanc.

• Tracer la droite A (molécule absorbance ; … nm) = f ((molécule absorbante ; solution X étalon diluée))

→ Le R2 doit être > 0,998

→ Le coefficient directeur est arrondi à un seul chiffre significatif.

FIN DU CODE

DOCUMENTS ÉLÈVES (à placer sur la paillasse)

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ALPHABET A DECRYPTER - (à glisser dans le dossier du chercheur)