Cours 12: Structure et diversité des génomes

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Définitions

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• Gène : élément d’un chromosome constitué d’ADN

délivre l’information nécessaire à la production d’un (plusieurs) ARN et donc d’une

(plusieurs) protéines

responsable de la transmission des caractères héréditaires

• Génome : ensemble de l’information génétique portée par la cellule

Le génome comprend à la fois les gènes et les séquences non-codantes de

l’ADN et de l’ARN

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Chiffres à retenir !!

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Tableau récap

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Tableau récap

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Points à retenir : virus

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• Taille des génomes des virus : quelques kilopaires de base (kb) à un

mégapaire de base (Mb)

• Le VHD est un sous virus satellite, c’est-à-dire qu’il ne peut se propager qu’en

présence d’un autre virus : le VHB

• VHD = simple brin d’ARN circulaire et fermé

• Mimivirus = virus à ADN double brin

• La structure et le mode de réplication des génomes viraux sont très variés

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Points à retenir : procaryotes

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• Taille des génomes bactériens : une centaine de kb à qq Mb

• Génome contenu dans une molécule d’ADN (chromosome) + circulaire et

libre dans le cytoplasme (pas de noyau)

• Les procaryotes possèdent une information extrachromosomique contenue

dans les plasmides

• Plasmides capables de s’intégrer dans les chromosomes = épisomes

• A ce jour : + de 1000 génomes bactériens ont été séquencés

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Points à retenir : eucaryotes

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• Taille des génomes eucaryotes : qq Mb à plusieurs centaines de milliards

de pb (Gb)

• Distinguer le génome nucléaire (dans le noyau) et les génomes contenus

dans les organites (génome mitochondrial, chloroplastique,…)

• Génome nucléaire chez l’Homme = réparti en 46 chromosomes

• L’Homme partage environ 30% de ses gènes avec Saccharomyces

cerevisiae (levure de boulanger)

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Points à retenir : eucaryotes

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Il n’existe aucun lien entre le contenu en ADN et la taille/ complexité

d’un organisme eucaryote

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Impact de la biologie moléculaire et de la génomique dans les domaines de la santé

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Date Méthodes Maladies concernées

Années 1970 Méthodes d’exploration des acides

nucléiques

- Isoler un gène, l’amplifier, le lire, le transcrire,

le modifier et l’intégrer dans le noyau

Maladies monogéniques

(ex: mucoviscidose,

myopathies)

Années 1980 Techniques de clonage positionnel

+ séquençage du VIH

Identification des causes

génétiques des maladies

monogéniques

Années 1990 Etudes dites d’association

Stratégie des gènes candidats

ADN recombinant

Maladies polygéniques (diabète,

HTA, Alzheimer, Parkinson, …)

= maladies multifactorielles

Progrès en thérapeutique

Années 2000 Thérapies géniques ou l’ADN médicament

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Projet Génome humain

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• Initié en 1990

• Publication d’une première ébauche du génome en 2001

• Version finale en 2003

• Total : 13 ans et 2,7 milliards de dollars

• Collaboration internationale

• France: Génoscope (Evry): séquençage du chromosome 14

• Après : Décrypter l’information génétique (avec la post-génomique + annotation du génome)

Identifier anomalies génomiques associées aux maladies

• Révolution génomique : (grâce aux biopuces et au séquençage au débit) -> coût et temps de

séquençage complet diminués!

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Enjeux de la post-génomique

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• connaissance du répertoire complet des gènes

• connaissance du transcriptome

• connaissance du protéome

• compréhension de l’importance fonctionnelle de l’ADN non codant et des ARN

non codants

• inventaire des interactions (interactome)

• inventaire des métabolites (métabolome)

• catalogue complet des sites polymorphes (variome)

• connaissance des cohortes de gènes impliqués dans les maladies polygéniques

• Pharmacogénomique

Outils : biopuces, séquençage haut débit et bio-informatique

A) La taille des génomes des procaryotes varie de quelques kilopairesde base à un mégapaire de base

B) Caenorhabditis elegans (ver), Arabidopsis thaliana (plante) et Homo sapiens (homme) possède une taille de génome proche

C) Arabidopsis thaliana (plante), Mus musculus (souris) et Homo sapiens (homme) possède un nombre de gènes proche

D) L’Homme partage environ 30% de ses gènes avec la levure de boulanger

E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte

QCM 1 : PARMI LES PROPOSITIONS SUIVANTES CONCERNANT LA TAILLE ET LA STRUCTURE DES GENOMES, QUELLES SONT LA OU LES PROPOSITIONS EXACTES ?

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A) La taille des génomes des procaryotes varie de quelques kilopairesde base à un mégapaire de base FAUX: d’une centaine de kb à qq Mb

B) Caenorhabditis elegans (ver), Arabidopsis thaliana (plante) et Homo sapiens (homme) possède une taille de génome proche FAUX: 100 Mb, 100 Mb et 3 Gb

C) Arabidopsis thaliana (plante), Mus musculus (souris) et Homo sapiens (homme) possède un nombre de gènes proche VRAI: 25 000 gènes, 24 000 gènes et 20 000 gènes

D) L’Homme partage environ 30% de ses gènes avec la levure de boulanger

E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte

QCM 1 : PARMI LES PROPOSITIONS SUIVANTES CONCERNANT LA TAILLE ET LA STRUCTURE DES GENOMES, QUELLES SONT LA OU LES PROPOSITIONS EXACTES ?

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A) La taille des organismes eucaryotes est proportionnelle à la taille de leur génome

B) Le génome du VHB est le plus petit génome connu de virus

C) Le génome d’Escherichia coli a une taille d’environ 10 mégapairesde bases (Mb)

D) Le génome de Mycobacterium tuberculosis comporte environ 525 gènes

E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte

QCM 2 : PARMI LES PROPOSITIONS SUIVANTES CONCERNANT LES GENOMES, QUELLES SONT LA OU LES PROPOSITIONS EXACTES ?

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A) La taille des organismes eucaryotes est proportionnelle à la taille de leur génome FAUX: absolument pas lié!!

B) Le génome du VHB est le plus petit génome connu de virus FAUX: génome du VHD

C) Le génome d’Escherichia coli a une taille d’environ 10 mégapairesde bases (Mb) FAUX: 5 Mb

D) Le génome de Mycobacterium tuberculosis comporte environ 525 gènes FAUX: 4 000 gènes

E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte

QCM 2 : PARMI LES PROPOSITIONS SUIVANTES CONCERNANT LES GENOMES, QUELLES SONT LA OU LES PROPOSITIONS EXACTES ?

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Cours 13: Composition du génome humain

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Génome humain

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• Regroupe : génome nucléaire (20 000 gènes) et le génome mitochondrial

(37 gènes)

• Génome nucléaire: 3 Gb, 20 000 gènes codant des protéines et plusieurs

milliers de gènes d’ARN transcrits mais non traduits

• Génome mitochondrial : ADN double brin circulaire de 16 569 pb, 37

gènes transmit uniquement par la mère, présent en de multiples copies, très

compact et très polymorphe

37 gènes

13 gènes Sous-unités protéiques de la chaîne respiratoire

22 gènes Synthèse ARNt

2 gènes Synthèse ARNr

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Génome nucléaire humain

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• Contenu en ADN des chromosomes variable selon leur taille

• Chromosome 1 = le plus long : 249 Mb

• Chromosome 21 = le plus court : 47 Mb

Partie fonctionnelle du génome Partie condensée inactive

Euchromatine Hétérochromatine

(au niveau des centromères, des bras courts des chromosomes

acrocentriques, du bras long du chromosome Y et sous forme de

segments dans diff chromosomes)

92% 8%

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Composition du génome humain

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Séquences répétées (répétitome)

Gènes protéiques (séquences régulatrices, exons et introns)

ADN codant

Séquences intergéniques non répétées et hétérochromatine

~50%

~25%

~25%

~1,5%

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Gènes codant les protéines

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20 000 gènes protéiques

10% de ces gènes codent pour des protéines dont la fonction n’est pas connue

100 000 protéines synthétisées par ces gènes

Gènes répartis en familles et superfamilles selon leurs fonctions ou leur

origine évolutive

• Les limites du gène ne sont pas précisément définies !

• Structure d’un gène

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Structure des gènes

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Début du gène en 5’:

région non transcrite

(jusqu’à qq dizaines

de kb)

-100 : région promotrice

Avec :

-90 : séquence CAAT

-25 à -30 : boîte TATA

Signal d’arrêt de la

traduction :

3 codons-stops:

UAA, UGA et UAG

10 à 20 pb avant la fin:

- séquence AATAAA (boite de

polyadénylation ou boite poly(A))

= signal de reconnaissance pour la

coupure du transcrit primaire

Site d’initiation

de la

transcription

(+1 du gène)

ATG : codon

d’initiation de la

traduction

Région 5’ UTR (région non traduite)

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Structure des gènes

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Région 5’ UTR Région 3’ UTR

= régions non traduites

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Caractéristiques

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• La taille des gènes protéiques est très variable !!

• Moyenne = 27 kb

• Dystrophine = 2,4 Mb (79 exons) = le plus long des gènes humains connus

• Titine = 30 000 acides aminés (363 exons) = la plus grande protéine humaine connue

• ARN pré-messager = exons + introns

• Les introns sont excisés lors de la maturation des ARNm

• Nombre d’exons par gène très variable

• En moyenne = 9 exons par gène

• Taille moyenne d’un exon = 150 pb ≠ Intron = 3 400 pb

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Régions 5’ et 3’ UTR

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Région 5’ UTR:

- Taille moyenne: 300 pb

- 15% des gènes

possèdent un intron en 5’

UTR

Région 3’ UTR:

- Taille moyenne: 770 pb

- Présence d’intron en 3’ UTR

très rare

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ADN non codant

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ADN non codant = ensemble des séquences du génome non traduites en

protéines ou sans fonction biologique identifiée (plus de 98% du génome).

Autre définition: séquences non retrouvées à l’intérieur des exons codants pour

des protéines

Classes d’ADNnc

Gènes des ARN non codants (ARNt, ARNr)

Pseudogènes

Introns

Segments de chromosomes dupliqués

Séquences d’ADNnc répétées en tandem

Séquences d’ADNnc répétées dispersées

ADN intergénique

ADNnc très conservé

Certaines classes se chevauchent !

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Représentation synthétique de la composition du génome humain avec des classes non chevauchantes

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Gènes à ARN non codant

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4 classes majeures d’ARNnc Caractéristiques

ARNt (ARN de transfert) ~500 gènes identifiés

- Nb de types d’anticodons inférieur au nb de codons qu’ils

décodent

- Anticodons produits par des gènes dont le nb de copies varie

d’une à plusieurs dizaines

~300 pseudogènes d’ARNt mis en évidence

ARNr (ARN ribosomique) Indispensables pour la traduction des protéines

Forment des regroupements appelés ADNr

ADNr = regroupements de centaines de copies de gènes à ARNr

(regroupés dans le nucléole dans la chromatine interphasique)

pARNno (petits ARN nucléolaires) Présents dans le nucléole

Aident à la maturation des ARNr

~100 identifiés

pARNn (petits ARN nucléaires) Interviennent dans l’épissage

Plusieurs dizaines identifiés

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Pseudogènes

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• Issus de la duplication des gènes ancestraux

• Accumulation de mutations les rendant non fonctionnels

• Existe plusieurs types : pseudogènes classiques, pseudogènes rétrotransposés et

les Numts (origine mitochondriale)

• ~14 000 pseudogènes

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Introns

17/11/2020

• Introns: séquences non codantes intercalées dans les gènes codant les

protéines

• Représentent plus d’un quart du génome humaine

• = proportion significative de l’ADN qui est transcrite

Bien faire la différence entre transcrit et traduit !!

- Une proportion significative de l’ADN est transcrite (les introns sont transcrits)

- Mais seulement 1,5% de l’ADN est traduit en protéines

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Segments de chromosomes dupliqués

17/11/2020

• Segments de chromosomes de 1 à 200 kb identiques = résultats de duplications

intrachromosomiques (entre Chr identiques) et interchromosomique (entre Chr

différents).

• ~5% du génome humain

• Localisés près des télomères et des centromères

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ADN répété en tandem

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• Contient ADNr et l’ADN satellite

• ADN satellite subdivisé en satellites, minisatellites et microsatellites

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ADN répété en tandem

17/11/2020

• Satellites: dans l’hétérochromatine au niveau des centromères

de 5 à 171 pb

~7% du génome

composant principal de l’hétérochromatine

• Microsatellites et minisatellites: seuil entre micro- et minisatellites = 10 pb

présentent un polymorphisme de répétition

• Microsatellites: motif répété de petite taille + très abondants sur le génome

marqueurs génomiques puissants

très souvent le motif répété est CA

• Minisatellites: motif de taille supérieure + nombre variable de répétitions

bases des premières analyses « d’empreintes génétiques »

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ADN répété dispersé

17/11/2020

• ADN répété dispersé = éléments mobiles (capables de se déplacer d’une région à une autre)

représente 45% du génome

divisé en 2 classes : - les éléments à ARN de classe I

- les éléments à ADN de classe II

(contient également les gènes à ARNt)

Classe I

(se transposent à travers un intermédiaire ARN)

+ de 40% du génome

Classe II

(se transposent directement de l’ADN

vers l’ADN)

Rétrotansposons à LTR

8% du génome

Séquences de 1 à 10 kb

Région LTR aux extrémités

= Transposons

Séquences de 2 à 3 kb codant une

transposase

3% du génome

La plupart = inactifs (ADN fossile)

On ne connaît pas leur rôle

LINE (longs éléments nucléaires intercalés)

6 kb

~500 000 copies (20% du génome)

SINE (petits éléments nucléaires intercalés)

100 à 400 pb

13% du génome

(famille Alu)

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ADN intergénique et ADNnc très conservé

17/11/2020

• L’ADN intergénique représente les ¾ du génome humain

• Rôle = dans la dynamique, l’évolution et la conservation des

génomes

• Composé en grande partie d’ADN répété

• L’ADNnc très conservé représente ~4% du génome humain

• Rôle = pas connu (mais peut-être dans la régulation de l’expression des gènes)

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Les gènes particuliers

17/11/2020

• Les gènes domestiques (ou gène de ménage) : gènes exprimés dans toutes les cellules

• Les gènes chevauchants : une même séquence peut porter 2 gènes différents

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Fiche récap

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A) La taille des moyenne de leurs introns est de 3 400 pb

B) Leur taille est en moyenne de 150 kb

C) Ils comportent en moyenne 19 exons

D) Leur région promotrice commence vers -25 à -30 bases par rapport au site d’initiation de la transcription

E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte

QCM 3 : PARMI LES PROPOSITIONS SUIVANTES CONCERNANT LES GENES HUMAINS DES PROTEINES, QUELLES SONT LA OU LES PROPOSITIONS EXACTES ?

17/11/2020 40

A) La taille des moyenne de leurs introns est de 3 400 pb

B) Leur taille est en moyenne de 150 kb FAUX: 27 kb

C) Ils comportent en moyenne 19 exons FAUX: 9 exons

D) Leur région promotrice commence vers -25 à -30 bases par rapport au site d’initiation de la transcription FAUX: vers -100

E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte

QCM 3 : PARMI LES PROPOSITIONS SUIVANTES CONCERNANT LES GENES HUMAINS DES PROTEINES, QUELLES SONT LA OU LES PROPOSITIONS EXACTES ?

17/11/2020 41

A) Les gènes codants les ARN de transfert (ARNt)

B) Les gènes codants les ADN ribosomiques (ADNr)

C) Les rétrotransposons à LTR

D) Les microsatellites et minisatellites

E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte

QCM 4 : PARMI LES SEQUENCES REPETEES DU GENOME HUMAIN, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) DISPERSEE(S) ?

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A) Les gènes codants les ARN de transfert (ARNt)

B) Les gènes codants les ADN ribosomiques (ADNr) FAUX: ADN répété en tandem

C) Les rétrotransposons à LTR

D) Les microsatellites et minisatellites FAUX: ADN répété en tandem

E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte

QCM 4 : PARMI LES SEQUENCES REPETEES DU GENOME HUMAIN, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) DISPERSEE(S) ?

17/11/2020 43

PARMIS LES PROPOSITIONS SUIVANTES, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) Le polymorphisme du génome est par définition des mutations neutres.

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• B) Le polymorphisme du génome peut être responsable de la susceptibilité de certaines maladies.

• C) Les polymorphismes sont des mutations qui ne dépassent pas les 1% de fréquence dans la population générale.

• D) Le polymorphisme du génome est responsable de la différence entre les individus.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

PARMIS LES PROPOSITIONS SUIVANTES, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) VRAI : Le polymorphisme du génome est par définition des mutations neutres.

17/08/2020 46

• B) VRAI : Le polymorphisme du génome peut être responsable de la susceptibilité de certaines maladies.

• C) FAUX : Les polymorphismes sont des mutations dépassent les 1% de fréquence dans la population générale.

• D) VRAI :Le polymorphisme du génome est responsable de la différence entre les individus.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

• Le polymorphisme du génome correspond à des mutations qui sont :

✓ Neutres

✓Dépassent la fréquence de 1% dans la population générale.

• Ces sites polymorphiques sont :

✓Plusieurs millions.

✓Responsables de la variation entre les individus

/!\ Même si la définition est qu’ils sont neutres, ils peuvent être responsables de susceptibilités de certaines maladies.

Définition

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LES DIFFERENTS VARIANTS

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PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) Les SNPs sont des mutations ponctuelles sous forme de substitutions.

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• B) Une adénine qui remplace une guanine est une transversion.

• C) On compte un total de 10 millions de SNPs de différences entre 2 individus.

• D) Ils sont inégalement repartis.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) VRAI : Les SNPs sont des mutations ponctuelles sous forme de substitutions.

17/08/2020 50

• B) FAUX : C’est une transition.

• C) FAUX : On compte un total de 2,5 millions de SNPs de différences entre 2 individus.

• D) VRAI : Ils sont inégalement repartis.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

Les SNPs sont des polymorphismes de substitution au niveau d’UNE seule base. Elles sont les plus fréquentes variations.

On parle de :

✓Transition (si une purine est remplacée par une purine ou une pyrimidine est remplacée par une pyrimidine)

Ex : C / T → représente les 2/3 des SNPs.

✓Transversion (si une pyrimidine est remplacée par une purine ou inversement)

Ex : A / T .

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LES SNPs

• On compte environ 10 millions de SNPs dans la population générale.

➔Autrement dit 1 SNP tous les 300 nucléotides dans la population générale.

▪On compte environ 2,5 millions de SNPs entre 2 individus.

➔Autrement dit, entre 2 individus, c’est 1 SNP tous les 1200 nucléotides.

ILS SONT INEGALEMENT REPARTIS !17/08/2020 52

LES SNPs

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LES SNPS

• Peuvent être codants ou pas

• Sont biologiquement neutres en général, s’ils ne changent pas la nature du codon (on parle de mutation synonyme)

• Sont recensés sur dbSNP

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LES SNPS

• Sont des délétions ou duplications qui vont de 1 Kb à plusieurs Mb

• Peuvent toucher plusieurs gènes et donc être responsables d’une augmentation quantitative de gènes (copie d’un ou plusieurs gènes).

• Font donc partie du polymorphisme QUANTITATIF.

• Sont recensés sur dbGV (database for genomicvariants)

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Les cnvs

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LES HAPLOTYPES

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE EST EXACTE ?

• A) Les haplotypes tendent à être plus longs en Afrique.

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• B) Les haplotypes sont des mutations.

• C) Le projet 1000 Génomes répertorie tous les haplotypes.

• D) Quelques centaines de milliers de SNPS suffiraient à répertorier l’ensemble des haplotypes.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE EST EXACTE ? /!\ QCU !!

• A) FAUX : Les haplotypes tendent à être plus courts en Afrique.

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• B) FAUX : Les haplotypes sont des mutations.

• C) FAUX : C’est HAPMAP.

• D) VRAI : Quelques centaines de milliers de SNPS suffiraient à répertorier l’ensemble des haplotypes.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

• Correspondent à un ensemble d’allèles ( partie d’un chromosome ) qui se transmettent de façon stables au fil des générations.

• La fréquence d’un haplotype varie d’une population à l’autre.

• Le projet HAPMAP identifie les haplotypes courants dans 4 populations originaires de diverses parties du monde ainsi que les SNP marqueurs.

• L’identification d’environ quelques centaines de milliers de SNP marqueurs suffisent pour identifier tous les haplotypes.

17/08/2020 59

LES HAPLOTYPES

17/08/2020 60

Exemple d’haplotypes

A savoir :Les haplotypes des populations non africaines sont souvent plus longs que les populations africaines. (car les africains étaient plus nombreux au tout début, et certaines populations ont migré hors de l’Afrique, ce qui explique que le brassage était plus important en Afrique que hors de l’Afrique)

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Le cholestérol

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) Le cholestérol possède un total de 5 cycles.

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• B) Il est issus d’un noyau stérone.

• C) Le cholestérol possède une double liaison entre C4 et C5

• D) Le cholestérol n’est pas un composant essentiel à l’organisme.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) FAUX : c’est 4 cycles.

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• B)FAUX : STERANE et non stérone.

• C) FAUX : Entre C5 et C6.

• D) FAUX : Au contraire, il participe à la formation des membranes notamment.

• E) VRAI : Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

17/08/2020 65

Le cholestérol

• Molécule à 27 carbones• Double liaison entre C5 et C6• Groupement hydroxyle en C3• Molécule à 4 cycles formée à partir du stérane• Le plus abondant des stérols• Molécule amphiphile = amphipatique• Structure rigide avec point de fusion élevé• Ester de cholestérol formé à partir de C3.

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) Le cholestérol possède 2 types de régulation.

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• B) La régulation allostérique est la régulation à long terme.

• C) L’ACAT permet l’esterification du cholestérol si il n’y en a pas assez.

• D) Le complexe SREBP, si le taux de cholestérol est diminué, va migrer vers le golgi et entrainer une diminution de l’ACAT.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) VRAI : A court et long terme.

17/08/2020 67

• B) FAUX : A court terme.

• C) FAUX : L’ACAT l’esterifie si il y’en à trop pour le stocker.

• D) VRAI : Le complexe SREBP, si le taux de cholestérol est diminué, va migrer vers le golgi et entrainer une diminution de l’ACAT.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

17/08/2020 68

Régulation de la synthèse du cholestérol

RAPPEL : l’HMG COA REDUCTASE est l’enzyme clef de la régulation de la synthèse du cholestérol.

17/08/2020 69

Synthèse du cholestérol

RAPPEL : Il faut juste retenir de la synthèse du cholestérol que c’est 3 molécules d’acétylCOA qui donneront du mévalonate grâce à l’HMG COA réductase. C’est cette étape qui permet en effet la régulation de la synthèse.

• Il peut être synthétisé par TOUTES les cellules, dans leur cytoplasme et dans leur RE.

• Synthèse endogène majoritairement dans le foie ++.

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Les Lipoprotéines

• Les lipoprotéines sont des structures discrètes transportant le cholestérol et les acides gras entre les sites de production (foie, intestin) et les sites de stockage, d’utilisation, ou d’élimination(tissus périphériques : musculaire et adipeux) pour les ré-estérifieren triglycérides et les stocker, et ceci de façon régulée grâce aux apolipoprotéines à la surface des lipoprotéines.

• Ils transportent donc :

✓Des triglycérides

✓Du cholestérol ESTERIFIE

• Ils possèdent dans leur membrane

✓Du cholestérol NON ESTERIFIE

✓Des apolipoprotéines

✓Des phospholipides membranaires.

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Les lipoprotéines

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) Les VLDL sont les lipoprotéines avec la densité la plus forte.

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• B) Les HDL sont les lipoprotéines avec la densité la plus faible

• C) Le HDL transporte uniquement des triglycérides.

• D) Les chylomicrons transportent uniquement des triglycérides.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

PARMIS LES PROPOSITIONS CI-DESSOUS, LAQUELLE (LESQUELLES) EST (SONT) EXACTE(S) ?

• A) FAUX : c’est le HDL.

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• B) FAUX : Cf A

• C) FAUX : On parle de HDL et de LDL cholestérol, donc le HDL et les LDL transportent QUE du cholestérol.

• D) VRAI : Les chylomicrons transportent uniquement des triglycérides.

• E) Aucune des propositions ci-dessus n’est exacte.

• Plus la densité est faible et son volume grand, et plus il y’a de triglycérides.

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Tableau à connaitre +++

• Le HDL cholestérol est le bon cholestérol.

• Le LDL est le mauvais cholestérol (plaque d’athérome)

• Les apolipoprotéines qu’ils possèdent ont un rôle :

✓Structurel

✓Donne un caractère intelligent à la LP en sachant vers où se diriger.

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Les lipoprotéines

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Le métabolisme des lipoprotéines

• Secrétés par vaisseaux lymphatiques intestinaux.

• Circulation sanguine direction tissus musculaire (court circuite le passage traditionnel par le foie).

• Rencontre de la LPL qui appauvrie les TG des chylomicrons

• Transformation des TG en AG avant d’être stockés dans les muscles et/ou adipocytes (ré-esterifcation)

• Chylomicrons deviennent « remnants » et seront catabolisés par le foie.

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Métabolisme des chylomicrons

• Sécrétion par le foie dans la circulation sanguine, surtout après un repas.

• Dégradation rapide par les LPL = libération de triglycérides.

• VLDL devient IDL, puis HDL grâce à la CETP (échange TG par cholestérol)

• Remnants des VLDL après dégradation= IDL et LDL (durée de vie longue, responsable de plaque

d’athérome).

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METABOLISME DES VLDL

• De l’organisme en direction du foie ➔Permet retour du cholestérol au foie notamment pour synthèse des acides

biliaires

• Issus de l’APO A 1 (synthétisée par le foie ou les intestins ou issus des chylomicrons ou d’ancien HDL).

• S’enrichissent en cholestérol pour devenir des préβ HDL

• Rencontre avec la LCAT qui forme les esters de cholestérol.

• HDL mature après être rentrés dans noyau.

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Métabolisme des HDL

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